论文
基因组学、统计学与癌症生物学方向的同行评审研究。
论文与项目正文为英文,此处的标题与摘要为中文翻译。
- 2024/Human Genetics and Genomics Advances
基于子集的跨组织转录组关联研究方法:提升统计效力与可解释性
Subset-based method for cross-tissue transcriptome-wide association studies improves power and interpretability
提出 CSTWAS 方法,在多个组织中自适应地选出关联最强的组织子集,在基因仅在少数组织中活跃时显著提升检验效力,并给出可供生物学解读的组织集合。
正文为英文 - 2024/Briefings in Bioinformatics
从 G1 到 M:细胞周期时相识别方法的比较研究
From G1 to M: a comparative study of methods for identifying cell cycle phases
在四套带有实验标签的数据上比较四种细胞周期时相预测方法,提出圆周误差度量,发现参考数据与待分析数据的匹配程度比方法本身更能决定准确率。
正文为英文 - 2024/Oncogene
ERK 过度激活是肢端雀斑样黑色素瘤中固有性与获得性 CDK4/6 抑制剂耐药的共同逃逸机制
ERK hyperactivation serves as a unified mechanism of escape in intrinsic and acquired CDK4/6 inhibitor resistance in acral lentiginous melanoma
揭示 CDK4/6 抑制剂通过降低 DUSP4 释放 ERK 通路、重新上调 cyclin D1 而导致耐药,并证明基因层面的 CDK4 通路改变无法预测蛋白表达或疗效。
正文为英文 - 2024/Cell Reports
SMYD2 对染色质修饰因子 KMT2D 的甲基化影响激素依赖性乳腺癌的治疗响应
Methylation of the chromatin modifier KMT2D by SMYD2 contributes to therapeutic response in hormone-dependent breast cancer
发现 KMT2D 在 K1330 位点被 SMYD2 甲基化,与相邻的 S1331 磷酸化位点双向互作;CRISPR 敲入实验表明该位点承载了 SMYD2 对治疗响应的大部分作用。
正文为英文 - 2024/The American Journal of Human Genetics
转录组与蛋白质组关联研究鉴定肾细胞癌相关基因
Transcriptome- and proteome-wide association studies identify genes associated with renal cell carcinoma
整合四套肾脏转录组与 48 个 GTEx 组织的关联分析,鉴定出多个不位于 GWAS 显著位点的候选基因,并用染色质可及性与 HIF 结合位点验证其调控证据。
正文为英文 - 2023/Cancer Discovery
肿瘤细胞自主表达的 Cxcl1 通过中性粒细胞来源的 TNF 维持免疫耐受与基质炎症
Cell-Autonomous Cxcl1 Sustains Tolerogenic Circuitries and Stromal Inflammation via Neutrophil-Derived TNF in Pancreatic Cancer
在胰腺导管腺癌中揭示肿瘤细胞 CXCL1 与 CXCR2 阳性髓系抑制细胞的空间互作如何排斥 T 细胞,并证明抑制 TNFR2 可显著提升化疗敏感性。
正文为英文